Home analisis genom aplikasi NGS deteksi patogen Illumina SBS Nanopore sequencing NGS Sekuensing DNA Teknologi Next Generation Sequencing Whole Genome Sequencing

Teknologi Next Generation Sequencing (NGS): Revolusi dalam Analisis Genom dan Deteksi Penyakit

Rachma Amalia Maharani
Rachma Amalia Maharani
Updated: • 0 • min read
Table of Contents
Teknologi Next Generation Sequencing (NGS) Revolusi dalam Analisis Genom dan Deteksi Penyakit

INFOLABMED.COM - Next Generation Sequencing (NGS) adalah teknologi mutakhir yang memungkinkan pengurutan DNA dan RNA secara cepat, akurat, dan efisien. 

Berbeda dengan metode sekuensing tradisional seperti Sanger, NGS mampu menghasilkan data dalam jumlah besar dengan biaya lebih rendah dan waktu lebih singkat.

Baca juga : Mengungkap Misteri Genom Manusia: Menelusuri Rangkaian Gen yang Membentuk Kehidupan

Apa Itu Next Generation Sequencing (NGS)?

Sekuensing adalah proses menentukan urutan basa nukleotida (A, T, G, C, atau U) dalam molekul DNA atau RNA. 

NGS adalah teknologi terbaru yang memungkinkan pengurutan jutaan hingga miliaran fragmen DNA secara paralel.

Keunggulan NGS:

  • Throughput tinggi: Dapat menganalisis banyak sampel sekaligus (multiplexing).
  • Sensitivitas tinggi: Mendeteksi varian genetik frekuensi rendah.
  • Cepat dan efisien: Waktu analisis lebih singkat dengan biaya lebih terjangkau.

Aplikasi NGS di Laboratorium Medis

  • Pemantauan Penyakit dan Deteksi Wabah.
  • Deteksi patogen seperti SARS-CoV-2, Dengue, Zika, dan lainnya secara cepat.
  • Analisis genom membantu melacak sumber dan pola penularan penyakit.
  • Pemahaman Penularan Penyakit.
  • Memetakan penyebaran patogen untuk pengendalian wabah lebih efektif.
  • Pengembangan dan Pemantauan Vaksin.
  • Mengidentifikasi target antigenik untuk vaksin.
  • Memantau mutasi virus yang memengaruhi efektivitas vaksin.

Evolusi Teknologi Sekuensing

  • Sanger Sequencing (1970-an): Metode tradisional dengan chain-termination technique.
  • NGS (Short-read): Menghasilkan pembacaan 150–300 bp (contoh: Illumina).
  • Third-Generation Sequencing (Long-read): Mampu membaca hingga 10.000 bp (contoh: Oxford Nanopore).

Workflow NGS: Illumina vs. Nanopore

  1. Illumina (Sequencing by Synthesis - SBS): Fragmentasi DNA → Amplifikasi PCR → Deteksi fluoresens.
  2. Nanopore (Disruption of Ionic Current): DNA melewati nanopore, mengubah arus ionik yang diterjemahkan menjadi sekuens.

Baca juga : Mengenal Lebih Jauh tentang Pengeditan Genom CRISPR

Strategi dalam NGS

  1. Whole Genome Sequencing (WGS): Mengurutkan seluruh genom.
  2. Targeted Sequencing: Fokus pada gen tertentu.
  3. Amplicon Sequencing: Amplifikasi fragmen target sebelum sekuensing.
  4. Metagenomics: Analisis seluruh DNA dalam sampel (misalnya mikrobioma).

Artikel ini hanya untuk tujuan informasi. Untuk nasihat atau diagnosis medis, konsultasikan dengan profesional.***

Rachma Amalia Maharani
Rachma Amalia Maharani Halo saya lulusan Teknologi Laboratorium Medik yang memiliki ketertarikan besar pada dunia kesehatan dan laboratorium klinik. Berpengalaman dalam praktik laboratorium selama masa studi dan magang, terbiasa bekerja secara teliti, disiplin, dan bertanggung jawab. Saya juga aktif mengembangkan diri melalui pembelajaran mandiri. I am looking for opportunities to contribute further to the health industry to be able to apply the knowledge and interests that I have. Let's connect on Linkedin in my Portfolio https://rachma-mlt.framer.website/

Post a Comment